פנימיית בויאר נוסדה ב- 1964 על ידי האגודה לקידום החינוך, ומהווה כבר למעלה מ-55 שנה שם נרדף למצוינות, איכות, מנהיגות ומעורבות חברתית.
הפנימייה מיועדת לבני נוער איכותיים בעלי יכולות לימודיות גבוהות, המעוניינים לממש את יכולותיהם בסביבה לימודית מאתגרת תוך מעורבות חברתית וקהילתית ובמטרה להפוך לאזרחים מובילים ומשפיעים בחברה הישראלית.
במהלך השנים התחנכו בפנימיית בויאר ובבית הספר התיכון בויאר אלפי בני נוער איכותיים בעלי יכולות לימודיות גבוהות, אשר לצד לימודיהם בתיכון בויאר היוקרתי נהנים מחיים חברתיים עשירים, הכוללים פעילויות ערכיות, חוגי העשרה מגוונים, סדנאות פיתוח אישי ומנהיגות, אירועים מוזיקליים, ערבי תיאטרון, מסעות וטיולים בטבע, פעילויות ספורטיביות ואירועים רבים בהובלת החניכים.
כל אלו נעשים במסגרת חמה ותומכת תוך ליווי אישי של צוותי חינוך והדרכה מקצועיים, עוטפים ומסורים, אוירה משפחתית וקשר עם הבית.
רבים מבוגרי הפנימייה השתלבו עם השנים בתפקידי מפתח בחברה הישראלית במגזר הציבורי, העסקי והשלישי, והחיבור הרגשי שלהם למקום מתבטא בין היתר במפגשי בוגרים מרגשים ובהתנדבויות באירועי הפנימייה.